产品类型多，性质差异大，分离纯化要求高，杂质限度要求高，通常需要低温纯化条件。料液通常为原辅料、医药中间体、医药成品的溶液，通常涉及菌体、蛋白、色素、内毒素、无机盐的脱除，高附加值多肽及其他药物的低温浓、溶剂回收等；膜元件及膜过滤系统，需要满足新药申报和GMP生产要求。
化学合成产物分子量小（通常 < 1000Da），传统蒸发、结晶、离子交换脱盐能耗巨大，操作繁琐，且易破坏产品。
内毒素（脂多糖，分子量10k-1000kDa）是医药产品关键杂质，常规方法难以彻底去除，且易与产物共沉淀。
多肽、蛋白质、热敏性药物在高温下易变性、降解或失活，传统蒸发浓缩温度高，产品质量风险大。
化学合成大量使用有机溶剂（甲醇、乙醇、丙酮、乙腈、DMF、DMSO等），传统膜材料耐溶剂性差，易溶胀、降解，分离效率低。
澄清除杂
膜元件：陶瓷膜
功能：去除菌体、不溶性颗粒、活性炭残留、胶体杂质
脱蛋白、内毒素，分级分离
膜元件：超滤膜
功能：脱除内毒素、脱除杂蛋白、超滤分级
脱色、脱盐、浓缩
膜元件：纳滤膜
功能：截留色素聚集体，去除合成反应中生成的无机盐，有机溶剂中产物浓缩
深度脱盐
膜元件：离子交换膜、RO膜
功能：螯合剂电渗析脱盐，合成类糖类似物电渗析脱盐，将料液浓缩至所需浓度
